大多数人们都在指定的机器上运行单个MySQL服务器，但在有些情况下，运行多个服务器是有好处的： 您可以在成品服务器运行的状态下测试新版本的服务器。在这种情况下，将运行不同的服务器。
操作系统通常将总进程限制施加于打开文件的描述符数量上。如果系统提高该限制值有困难，则运行多个服务器是解决该限制的办法（例如，提高限制可能需要重新编译该内核，并且，如果该机器不是您的管辖范围，可能还不能这样做）。在这种情况中，您可能会运行相同服务器的多个实例。
互联网服务经常提供给顾客他们自己的MySQL安装程序，它需要单独的服务器。在这种情况下，您可能会运行相同服务器或不同服务器的多个实例，如果不同的顾客需要不同MySQL版本的话。
当然，同时运行几个服务器比只运行一个更复杂。如果您打算安装多个版本，则不能将它们都安装在相同的位置。当服务器运行时，某些参数对于每个服务器必须是唯一的。其中有些参数包括在服务器安装的地方：数据目录的路径名、TCP/IP 端口和UNIX 域的套接字路径名，以及用于运行多个服务器的UNIX 账号（如果不在相同的账号下运行所有的服务器的话）。如果决定运行多个服务器，则必须保持对正在使用的参数有良好说明，以便不失去对运行的跟踪。
如果打算运行不同版本的服务器而非相同服务器的多个实例，应该在不同的位置安装它们。如果安装二进制（不是R P M）分发包，它们将在包含版本号的目录名下被安装。如果从源程序分发包中安装，使不同的分发包分开的最容易的办法是，当在每个版本的MySQL安装过程中运行configure 时使用--with-prefix 选项。这将导致在单独的目录下进行安装，并且可以连接该目录到该分发包的版本号上。例如，您可以按如下配置一个MySQL分发包，这里的version 是MySQL的版本号：
% ./configure ..with-prefix=/usr/local/mysql-version
with-prefix 选项还将确定服务器的唯一数据目录。您可能会增加选项来配置其他的服务器专有的值，如TCP/IP 端口和套接字路径名（ --with-tcp-port 和- - w i t h - un i x - s o c k e t）。
如果打算运行相同服务器的多个实例，则服务器专用的任何选项将需要在运行时指定。
多个服务器的启动过程
启动多个服务器比使用单个服务器复杂，因为safe_mysqld 和mysql.server 二者均在单个服务器上工作良好。笔者建议您仔细研究safe_mysqld 并用它作为启动过程的基础，除非您使用按自己的需求修改得更精细的拷贝。
必须处理的一个问题是如何在选项文件中指定选项。对于多个服务器，不能对在总服务器基础上变化了的设置使用/ e t c / my.cnf，只能为所有服务器都相同的设置使用该文件。如果每个服务器都有不同的数据目录位置，可以在每个服务器数据目录的my.cnf 文件中指定服务器专有的参数。换句话说，应为所有服务器都使用的设置使用/ e t c / my.cnf，并且为服务器专有的设置使用DATA D I R/ my.cnf，这里的DATADIR 随每个服务器变化。
指定服务器选项的另一种方法是：使用- - d e f a ul t s - f i l e =p a t h _ name 作为该命令行的第一个选项，以便告诉服务器从path_name 指定的文件中读取选项。这样，可以将该文件中的服务器选项唯一地放置到那个服务器中，然后告诉服务器在启动时读取该文件。请注意，如果指定该选项，则没有任何通常的选项文件（如/ e t c / my.cnf）将被使用。