问题现象，具体如下所示：
故障分析：
一般来说，出现这种情况是因为电脑误删系统文件或者是系统文件被顽固木马破坏。
解决方法：
1、下载360安全卫士，找到里面的急救箱开始急救，然后进行修复，完成后重新启动；
2、下载瑞星杀毒软件，清理一下系统，查杀一下木马，清理开机启动的错误项等；
3、用系统自带的系统还原，还原到你没有出现这次故障的时候修复(或用还原软件进行系统还原，假如进不了系统，开机按F8进入安全模式还原系统)；
4、假如故障依旧，使用系统盘修复，打开命令提示符输入SFC /SCANNOW 回车(SFC和/之间有一个空格)，插入原装系统盘修复系统，系统会自动对比修复的；
5、假如故障依旧，在BIOS中设置光驱为第一启动设备插入原装系统安装盘按R键选择“修复安装”即可；
6、假如故障依旧，建议重装Windows 7操作系统。
以上就是对Windows 7旗舰版系统提示应用程序错误代码0xc0000409的故障原因及解决方法全部内容的介绍，希望上述六大方法能够帮助大家！